Wzorce ekspresji genów w opornych na leki komórkach ostrej białaczki limfoblastycznej i odpowiedź na leczenie ad 6

Podobnie analizy głównych składowych prawidłowo grupowały próbki od większości pacjentów do odpornego lub wrażliwego klastra dla każdego z czterech czynników przeciwbiałaczkowych (ryc. 2). Hierarchiczne grupowanie i analizy głównych składników obejmujące wszystkich 173 pacjentów dały podobne wyniki (ryc. 3 i 4 w dodatkowym dodatku). Identyfikacja zestawu sond, nazwy genów, adnotacje i stosunek ekspresji genu w opornych na wrażliwe komórki białaczki dla genów różnicujących pokazano dla każdego leku na Figurach 5, 6, 7 i 8 (linia B ALL) i 9, 10, 11 i 12 (linia B i kombinacja T-cell w połączeniu) w dodatkowym dodatku. Geny oporności, połączone wyniki ekspresji genów i wyniki leczenia
Rycina 3. Rycina 3. Estymaty Kaplan-Meier z czasu przeżycia wolnego od choroby wśród 173 pacjentów w pierwotnej grupie badawczej (panel A) i 98 pacjentów w kohorcie walidacyjnej (panel B), w zależności od tego, czy wzorzec odporności komórkowej wskazuje na oporność komórkową lub wrażliwość na czterech leków przeciwbiałaczkowych. W każdym panelu, pacjenci są grupowani zgodnie z ich połączonymi wynikami oceny ekspresji genów odporności na leki dla 172 zestawów sond dla prednizolonu, winkrystyny, asparaginazy i daunorubicyny. Wskazano 33 procent z najniższym wynikiem (wskazującym na czułość), 33 procent z oceną pośrednią (wskazującą na pośredni poziom oporności) i 33 procent z najwyższym wynikiem (wskazującym na oporność).
Tabela 1. Tabela 1. Wieloczynnikowa analiza zagrożeń proporcjonalnych ryzyka nawrotu. W przypadku 173 pacjentów leczonych zgodnie z holenderskimi i niemieckimi protokołami mediana okresu obserwacji wynosiła 4,2 roku; 132 pacjentów pozostawało w ciągłej całkowitej remisji, 40 pacjentów miało nawrót, a pacjent miał drugi nowotwór, w którym to czasie dane dotyczące tego pacjenta były cenzurowane. Wysoki wynik połączonej ekspresji genu wskazujący na oporność na cztery leki wiązał się ze znacznie zwiększonym ryzykiem nawrotu (p = 0,001) (ryc. 3A). Połączony wynik ekspresji genu odporności na leki również przewidywał wynik leczenia w analizie wieloczynnikowej, która obejmowała wiek pacjenta, ALL podtyp genetyczny, WSZYSTKIE linie i liczbę leukocytów w momencie rozpoznania (współczynnik ryzyka nawrotu z wysokim wynikiem w porównaniu z niski wynik, 3,0; P = 0,027) (tabela 1).
Połączony wynik ekspresji genowej był testowany w niezależnej kohorcie 98 pacjentów z USA, którzy byli leczeni tymi czterema lekami, ale według innego protokołu. Mediana czasu obserwacji tych pacjentów wynosiła 7,0 lat; 17 pacjentów miało nawroty, 9 miało konkurencyjne zdarzenia (7 miało drugie raki, a remisja nie powiodło się w 2), a 72 pozostawało w ciągłej całkowitej remisji. Podobnie jak w zestawie treningowym, wysoki wynik połączonej ekspresji genu odporności na leki wiązał się ze znacznie zwiększonym ryzykiem nawrotu (p = 0,003) (ryc. 3B). Kiedy wiek pacjenta, genetyczny podtyp ALL, WSZYSTKIE linie i liczba leukocytów w momencie diagnozy zostały uwzględnione w analizie wieloczynnikowej, wysoki wynik połączonej ekspresji genu odporności na leki był niezależnie związany z wyższym prawdopodobieństwem nawrotu niż był niski wynik ( współczynnik ryzyka 11,85; P = 0,019) (Tabela 1).
Klasyfikacja ontologiczna genów dyskryminacyjnych
Rysunek 4
[hasła pokrewne: polyporus, buprenorfina, ambrisentan ]
[patrz też: remifemin opinie, otłuszczona watroba, stoperan elektrolity ]